На 19 април през 2007 година Цар Калоян беше тържествено погребан с държавни почести в църквата „Свети Четиридесет мъченици“ във Велико Търново.
Ритуалът започна с изнасяне на саркофага от Регионалния исторически музей. Той бе носен от гвардейци и увит в националния трибагреник, поставен върху лафет, теглен от бронетранспортьор на въоръжените сили под звуците на барабани. В началото на шествието гвардеец носеше графичен портрет на образа на цар Калоян.
На тържествената церемония присъстваха президентът Георги Първанов, министрите проф. Стефан Данаилов и Веселин Близнаков, депутати, кметове на градове от цялата страна. Великотърновския митрополит Григорий отслужи заупокойна молитва.
Любопитен факт е, че саркофагът е положен в гроб номер 39 в църквата, където е открит прочутият Калоянов пръстен.
Преди да бъдат препогребани, костите от гроб № 39 са обработени с восъчно-колофониев препарат, използван и при балсамирането на египетските мумии. Те са затворени в непроницаем за въздух и влага метален саркофаг, имащ гаранция 3000 години.
Всяка година на 22 март – празника на Велико Търново, официални лица, гости и жители на града полагат цветя на саркофага на цар Калоян.